期刊简介
本刊1995年公开发行，大16开，64页，1995年-2000年为季刊，2001年改为《肿瘤学杂志》，月刊，主要刊登肿瘤临床与基础，科研等学术研究论文，1997-1998年被浙江省科技期刊编辑学会及浙江省期刊协会科技期刊委员会评为优秀期刊二等奖。
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首页>肿瘤学杂志
- 杂志名称：肿瘤学杂志
- 主管单位：浙江省卫生和计划生育委员会
- 主办单位：浙江省肿瘤医院 浙江省抗癌协会
- 国际刊号：1671-170X
- 国内刊号：33-1266/R
- 出版周期：月刊
期刊荣誉：1997-1998年度浙江省优秀期刊二等奖期刊收录：统计源核心期刊(中国科技论文核心期刊), 国家图书馆馆藏, 知网收录(中), 万方收录(中), CA 化学文摘(美), 上海图书馆馆藏, 维普收录(中)
利用基因芯片重注释筛选肝细胞肝癌术后复发相关lncRNA
曾玮；陈平
关键词：肝细胞肝癌, LncRNA, 术后复发, 预后
摘要：[目的]利用基因芯片重注释寻找肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)术后复发相关lncRNA(long non-coding RNA).[方法]首先利用生物信息的方式重新注释35/41例复发/未复发HCC病例的基因表达谱数据,筛查与HCC术后复发相关的差异表达lncRNA.然后利用ROC曲线评价差异lncRNA的术后复发预测效能.后利用基因共表达网络与功能富集分析探究差异lncRNA具体的生物学功能.[结果]差异表达分析发现3个lncRNA(LINC00342,LINC00607,LINC01553)显著差异表达[|log(fold change)|＞1,q value＜0.05].ROC曲线分析发现该3个差异lncRNA的AUC值为0.693.基因共表达网络分析发现LINC00342相关共表达网络显著富集到“细胞周期”相关功能;LINC00607相关的共表达网络中基因主要富集到“炎症反应”与“免疫反应”相关的生物学功能与通路;LINC01553相关的共表达网络中基因主要富集到“DNA复制与修复”相关的生物学功能与通路.[结论]3个lncRNA与HCC术后复发显著相关,可作为一种潜在的诊断标志物组合,值得进一步的挖掘与研究.
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